L'enseignement magistral est dispensé sous forme de cours et de travaux pratiques (500h). Les cours donnent le cadre théorique, exposent les idées directrices et définissent les fondements des matières enseignées. Les travaux pratiques, à travers de nombreux exercices et mini-projets, facilitent l'assimilation des concepts vus en cours. Un projet de fin d'étude (90h) permet d'acquérir le sens du travail en équipe et le savoir-faire nécessaire à une utilisation efficace des systèmes et des outils informatiques. De nombreuses conférences par des experts du domaine et par des industriels ainsi que des visites d'entreprise complètent cette formation académique.

Les enseignements sur l'analyse et la conception de logiciels dans un contexte d'ingénierie des modèles sont structurés en trois volets : la méthode de conception et l'assurance qualité ; les technologies de conception du coeur des applications et de leurs interfaces ; et enfin, la vérification et le test des logiciels implantés. Cependant, la formation GL couvre aussi les enseignements de base communs aux spécialités « Mitic » et ingénierie des réseaux, comme par exemple les concepts fondamentaux sur les protocoles réseaux (Unité d'enseignement RIC par exemple).
Pour compléter cette formation au génie logiciel, plusieurs enseignements spécialisés sont proposés en option, par exemple sur la sécurisation des applications ou les architectures à base de composants. Certaines de ces options peuvent être proposées à des étudiants d'autres spécialités du master professionnel en informatique.
Inversement, certains enseignements spécialisés offerts par les autres spécialités du master professionnel en informatique sont proposés en option ou en choix libre pour la spécialité GL, permettant ainsi aux étudiants d'acquérir des connaissances plus approfondies sur les aspects multimédia, par exemple, en fonction de leur projet professionnel.

L'enseignement magistral est complété par un stage en entreprise à partir du mois de mars, d'une durée minimale de 16 semaines et maximale de 6 mois. Ce stage permet aux étudiants de concrétiser, sur le terrain, leurs acquis et prépare leur insertion professionnelle.

Les 7 UE obligatoires du parcours de la spécialité « Génie Logiciel » (GL) sont les suivantes :
- GLPS : Génie Logiciel , Programmation et Systèmes (3 ECTS)
Langage objet ( Java ), concepts et méthodes de programmation , modélisation et conception ( UML ), gestion technique de projet , atelier de génie logiciel , bases de données , notions de base des systèmes transactionnels .
- SCO : Spécification et Conception Objet (3 ECTS)
Spécification et conception par objets , méthodologie, patrons de conception.
- IHM : Interfaces Homme - machine (3 ECTS)
Méthodes, modèles et outils de conception des interfaces homme-machine .
- V & V : Validation et Vérification (3 ETCS)
Techniques de test (structurel/fonctionnel, unitaire/intégration et système), de prévention des défauts (conception testable) et de correction des fautes détectées (diagnostic et "debugging").
- MEF : Méthodes formelles pour le génie logiciel (4 ECTS)
Spécification ensembliste , raffinement , implantation , démonstration de propriétés .
- RIC : Réseaux Internet et Communications (2 ECTS)
Principes de fonctionnement de base des réseaux , communication et de synchronisation entre processus sous Unix , outils de programmation permettant le développement de logiciels répartis .
EXP : Culture scientifique, Projet,