A l'issue du stage, le participant, spécialiste des peptides, sera capable :
de dialoguer utilement avec un service de spectrométrie de masse.
de comprendre la nature et l'intérêt des informations données par cette technique.
Ce stage n'est donc pas destiné à apprendre la manipulation d'un spectromètre de masse.
Nous conseillons aux personnes intéressées par des manipulations pratiques de demander un stage de ''Spectrométrie de masse à la carte'', qui pourrait alors se dérouler le lundi précédent et le vendredi suivant cette formation
A. Principaux points abordés dans la partie théorique :
1. Divers types de spectromètres de masse.
2. Les modes d'ionisation F.A.B., Electrospray et MALDI.
3. Intérêt d'une mesure de masse moléculaire pour les peptides en chimie ou biologie. Masse monoisotopique et chimique, séquençage.
4. Utilisation de la spectrométrie de masse comme critère de pureté.
5. Préparation de l'échantillon (purification HPLC, gel 2D, digestion trypsique robotisée).
6. Le couplage HPLC-MS sur colonne classique, nano et micro.
7. Application dans le cadre de la protéomique.
B. Partie pratique :
1. Calcul de la masse moléculaire et des pics de fragmentation par ordinateur.
2. Présentation d'appareils magnétiques, quadripolaire, trappe ionique et Q-Tof avec Ionisation électrospray.
3. Présentation d'un appareil MALDI-TOF-TOF
4. Analyse de quelques peptides ou protéines apportés par les participants.
5. Manipulations en LC-MS-MS.
6. Application en protéomique : utilisation de données MALDI et MS-MS pour identification de protéines avec les moteurs de recherche classiques.
Informations complémentaires :
Méthodes pédagogiques
Cette formation théorique et pratique fait intervenir du matériel particulièrement coûteux. Application sur des protéines naturelles ou recombinantes ainsi que sur des peptides de synthèse, avec utilisation en routine du couplage chromatographie liquide - spectrométrie de masse (LC-MS).
Cette formation peut être couplée à un stage de ''Spectrométrie de Masse à la carte'', qui prépare aux manipulations pratiques
Voir toutes les formations DEPULP