UNIVERSITÉ Paris Diderot

DU : Création, analyse et valorisation de données biologiques omiques

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Objectifs

Ce diplôme universitaire offre la possibilité d’acquérir le savoir-faire nécessaire à l’analyse des données haut débit depuis le plan d’expérience jusqu’à la publication des résultats. Très opérationnelle, cette formation permet aux stagiaires de travailler avec leurs propres données pour développer et renforcer des compétences en création, analyse et valorisation de données omiques (génomique, transcriptomique, protéomique).

Compétences visées :

À l’issue de la formation, le stagiaire sera capable :

  • D’organiser, analyser et de valoriser un projet scientifique reposant sur des approches expérimentales haut débit.
  • D'interagir efficacement avec des informaticiens et des statisticiens.


Public visé

  • Cette formation est destinée aux ingénieurs, post-doctorants, chercheurs et enseignants- chercheurs, du secteur public comme du secteur privé.
  • Ce diplôme universitaire s’adresse à des personnes en situation professionnelle avec une première expérience d’approche haut débit et titulaire au minimum d’une licence en biologie.

Programme

La formation s’articule autour de 10 sessions de 2 jours réparties sur une année civile, chacune organisée comme suit :
  • Jour 1 : 6h de cours et de travaux pratiques + 1h de travail en autonomie à l’université.
  • Jour 2 : 3h de cours et de travaux pratiques + 4h de travail en autonomie à l’université.
Entre les sessions : 4h de travail distanciel. Au total, cela représente 90h de cours/TP et 90h de mise en situation avec encadrement et seront organisés autour de séquences de cours théoriques relativement courtes, pour laisser une large place à la réalisation pratique. L’enseignement est organisé en 6 modules fonctionnant de manière transverse et continue, de façon à reproduire la démarche d’un laboratoire de recherche :
  • Plan d’expérience et génération de données - omiques : Réflexions sur le plan d’expérience et les méthodes de génération de données - omiques.
  • Gestion de données expérimentales et reproductibilité des analyses : Sensibilisation à la gestion de données et à la reproductibilité des analyses.
  • Outils statistiques : Compréhension des outils statistiques indispensables à l’analyse des données - omiques.
  • Automatisation du processus d’analyse de données : Automatisation du processus d’analyse de données (création de worflows).
  • Présentation et valorisation des résultats pour publication : Méthodes de représentation de données, outils logiciels associés.
  • Mise en situation et projet : Exercices pratiques et mise en application des compétences acquises dans un projet personnel.
 

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À Paris

De l'année 2019 à 2020

Centre

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5 rue Thomas-Mann
75205 Paris cedex 13
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En résumé

Objectif

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Durée

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Coût

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Modes d'enseignement

En école ou centre de formation

Type d'établissement

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Domaine

Biologie

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