Université Paris Cité
DU Création, analyse et valorisation de données biologiques omiques
Autre diplôme niveau BAC+3
180 heure(s)
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Objectifs
Présentation DU Création, analyse et valorisation de données biologiques omiques :Très opérationnelle, cette formation permet aux stagiaires:
de travailler avec leurs propres données pour développer et
renforcer des compétences en création, analyse et valorisation de données omiques (génomique, transcriptomique, protéomique).
Compétences visées
A l’issue de la formation, le professionnel est capable de :
Définir un plan d’expérience et choisir le(s) méthode(s) de génération de données omiques
Gérer des données et garantir la reproductibilité des analyses
Appliquer les outils statistiques adaptés à l’analyse des données omiques
Automatiser le processus d’analyse de données (création de workflows)
Présenter et valoriser les résultats pour publication
Public visé
Ce diplôme universitaire s'adresse à des personnes en situation professionnelle du secteur public comme du secteur privé, souhaitant utiliser des données expérimentales haut débit :
Ingénieurs,
Post-doctorants,
Chercheurs,
Enseignants.
Programme
Référence formation : DUS051
Volume horaire : 180 heures
Commission d'admission: 13 octobre 2022
Calendrier : Du 12 janvier 2023 au 1er décembre 2023
Rythme : la formation se compose de 10 sessions, à raison de 2 jours par mois pendant 10 mois.
Session 1: Jour 1: 12/01/2023 Jour 2: 13/01/2023
Session 2: Jour 1: 09/02/2023 Jour 2: 10/03/2023
Session 3: Jour 1: 09/03/2023 Jour 2: 10/03/2023
Session 4: Jour 1: 06/04/2023 Jour 2: 07/04/2023
Session 5: Jour 1: 11/05/2023 Jour 2: 12/05/2023
Session 6: Jour 1: 01/06/2023 Jour 2: 02/06/2023
Session 7: Jour 1: 29/06/2023 Jour 2: 30/06/2023
Session 8: Jour 1: 21/09/2023 Jour 2: 22/09/2023
Session 9: Jour 1: 19/10/2023 Jour 2: 20/10/2023
Session 10: Jour 1: 30/11/2023 Jour 2: 01/12/2023
Lieu : Site Grands Moulins - Université de Paris Cité
CONTENUS PÉDAGOGIQUES:
Plan d’expérience et génération de données "omiques"
Gestion de données expérimentales et reproductibilité des analyses
Outils statistiques
Automatisation du processus d’analyse de données (création de workflows)
Présentation et valorisation des résultats pour publication, méthodes de représentation de données, outils logiciels associés
Projet (mise en application des compétences acquises dans un projet personnel)
MOYENS PÉDAGOGIQUES ET TECHNIQUES D'ENCADREMENT
Équipe pédagogique
Responsable pédagogique: Bertrand Cosson est Professeur à Université de Paris en biologie moléculaire. Il est spécialisé dans l’étude des régulations de l’expression des gènes et développe une application haut débit émergente centrée sur l’étude du couplage transcriptome/traductome.
Pierre Poulain est Maître de conférence et Spécialisé en intégration de données et développe des méthodes d’analyse en protéomique.
Gaëlle Lelandais est Professeur et elle a des compétences reconnues en analyse de données et bioinformatique pour la génomique fonctionnelle.
Moyens d'enseignement pédagogique
90 h de cours/TP et 90 h de mise en situation avec suivi pédagogique. Les cours/TP bénéficient d’un triple encadrement et sont organisés autour de séquences de cours théoriques relativement courtes, pour laisser une large place à la réalisation pratique. L’enseignement est organisé en 6 modules fonctionnant de manière transverse et continue, de façon à reproduire la démarche d’un laboratoire de recherche.
Ressources matérielles
Un ordinateur est mis à disposition lors des sessions à l’université ainsi qu’un accès à un serveur dédié.
Afin de favoriser une démarche interactive et collaborative, différents outils informatiques seront proposés pour permettre :
- d’échanger des fichiers, des données ;
- de partager des ressources, des informations ;
- de communiquer simplement en dehors de la salle de cours et des temps dédiés à la formation.
L’enseignement est en français, avec de nombreux supports de cours en anglais
MOYENS PERMETTANT DE SUIVRE L’EXÉCUTION DE L’ACTION ET D’EN APPRÉCIER LES RÉSULTATS
Au cours de la formation, le stagiaire émarge une feuille de présence par demi-journée de formation en présentiel et le Responsable de la Formation émet une attestation d’assiduité pour la formation en distanciel.
À l’issue de la formation, le stagiaire remplit un questionnaire de satisfaction en ligne, à chaud. Celui-ci est analysé et le bilan est remonté au conseil pédagogique de la formation.
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Durée
180 heure(s)
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