Université Paris Cité

DU Bioinformatique et Data management

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100 heure(s)

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Objectifs

Présentation DU Bioinformatique et Data management :
Cette formation d'acquérir les compétences complémentaires requises en :

  • Informatique : Gestion de bases de données, gestion informatisée de sources documentaires ainsi qu’une initiation à la programmation.

  • Statistiques : Des bases solides dans le traitement statistique de données issues d’essais pré-cliniques et cliniques.

  • Bonnes pratiques cliniques.
Et après ?

Poursuite d'études : Vous pouvez toujours compléter ou acquérir de nouvelles compétences en vous inscrivant à d'autres diplômes d'université ou des séminaires.

Public visé

  • Les étudiants (en Pharmacie ou en Médecine ou ayant validé une licence Sciences de la Vie ou une licence scientifique) inscrits au master Sciences de la Vie et de la Santé.
  • Les étudiants en Pharmacie ou en Médecine internes ou inscrits en DES ou DIS.
  • Les étudiants ayant validé au moins une licence Sciences de la Vie ou une licence scientifique (ou équivalence) et qui ne sont pas inscrits au master Sciences de la Vie et de la Santé.

Programme

Référence formation : DUB001


Calendrier : Septembre à juin


Rythme : 30 demi-journées


Lieu Faculté de Pharmacie de Paris 6e


Moyens pédagogiques et techniques : Les supports pédagogiques sont mis à disposition des stagiaires sur Moodle.


PROGRAMME


Au 1er Semestre :


Module 1 - Premiers pas en Python (30 h en présentiel)


18 heures Enseignements théoriques

12 heures en travaux pratiques

Initiation à la programmation en langage Python


Traitement de données textuelles (séquences)


Utilisation de modules externes (biopython)


Projet de programmation


Module 2 : Initiation au Data Management en santé (30 h alternance)


21 heures Enseignements théoriques en présentiel

9 heures en travaux pratiques avec tutorat à distance

Structure d’une base de données, procédures de codage, classification


Conception, création, gel, validation, nettoyage d’une base de données


Exploitation d’une base de données : information et bruit, hiérarchie et classification


Le métier de data manager


Projet personnel de création de base de données


Au 2nd semestre :


Module 3 : Programmation appliquée aux bases de données (40 h)


20 heures Enseignements théoriques en présentiel

20 heures en travaux pratiques avec tutorat à distance

Plateforme de cours en ligne


- langages SQL, et PHP


création d’interfaces dynamiques de bases de données sous SQL/PHP


Ressources matérielles


Afin de favoriser une démarche interactive et collaborative, différents outils informatiques seront proposés pour permettre :


d'échanger des fichiers, des données

de partager des ressources, des informations

de communiquer simplement en dehors de la salle de cours et des temps dédiés à la formation.

MOYENS PERMETTANT DE SUIVRE L’EXÉCUTION DE LA FORMATION ET D’EN APPRÉCIER LES RÉSULTATS


Au cours de la formation, le stagiaire émarge une feuille de présence par demi-journée de formation en présentiel et le Responsable de la Formation émet une attestation d’assiduité pour la formation en distanciel.


À l’issue de la formation, le stagiaire remplit un questionnaire de satisfaction en ligne. Celui-ci est analysé et le bilan est remonté au conseil pédagogique de la formation.

 

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En résumé

Objectif

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Durée

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Modes d'enseignement

Type d'établissement

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Domaine

Biologie

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